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Alvaro Sebastian
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Chuleta de Python 3 para principiantes
Hoy quiero compartir con vosotros una chuleta de Python 3 que he creado para mis estudiantes, he intentado recopilar en dos caras de DIN-A4 los tipos de datos, operadores, métodos, funciones y otros contenidos útiles que uno necesita tener a mano cuando com...
Chuleta de Python 3 para principiantes
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bioinfoperl.blogspot.com.es

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Seminario de introducción a la metagenómica
Os quiero anunciar que el 19 de Octubre impartiré el workshop titulado "Introduction to Bioinformatics applied to Metagenomics and Community Ecology" como parte de la conferencia ​ Community Ecology for the 21st Century (Évora, Portugal). Si estáis interesa...

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Si los médicos tuvieran que trabajar de bioinformáticos...
Hoy os publico una viñeta que me ha hecho gracia y se adapta muy bien a la bioinformática... desgraciadamente se cumple totalmente, sobretodo lo del conserje... El original aquí: http://sinergiasincontrol.blogspot.com/2008/10/33-suposiciones.html

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Anotando datos del NCBI de forma automática con un script de Perl
Esta semana me di cuenta que un antiguo script de Perl que leía datos bibliográficos de Pubmed automáticamente había dejado de funcionar. La explicación es que el NCBI ha dejado de dar soporte a su servicio web con el protocolo SOAP . No soy un experto info...

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Genotipado HLA y software disponible
En la presente entrada intentaré hacer una recopilación de software para el genotipado de HLA (MHC humano) , en la sección de comentarios podéis añadir otras herramientas que intentaré incorporar al texto. Para escribir la entrada me resultó muy útil el sig...
Genotipado HLA y software disponible
Genotipado HLA y software disponible
bioinfoperl.blogspot.com

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Secuenciación de amplicones y genotipado de alto rendimiento I (Introducción)
Secuenciación de amplicones (SA)   es una traducción aproximada al español de la técnica de " Amplicon sequencing " que junto con las tecnologías de secuenciación masiva (del inglés new generation sequencing, NGS) permite genotipar cientos/miles de individu...

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Curso de Python para biólogos - Lección 7. Lectura y escritura de archivos
Con Python podemos leer, crear y modificar archivos de texto . Por ejemplo podemos leer un fichero con miles/millones de secuencias de DNA y extraer información del mismo, lo cual sería muy complicado de forma manual. Se verá un ejemplo al final de la lecci...

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Curso de Python para biólogos - Lección 7. Lectura y escritura de archivos
Con Python podemos leer, crear y modificar archivos de texto . Por ejemplo podemos leer un fichero con miles/millones de secuencias de DNA y extraer información del mismo, lo cual sería muy complicado de forma manual. Se verá un ejemplo al final de la lecci...

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Curso de Python para biólogos - Lección 6. Bucles 'for'
En la lección de hoy presentaremos los bucles 'for', muy similares a los 'while' explicados en la lección 4 , pero con un código más sencillo. Bucles 'for': Un bucle 'for', al igual que ' while ', repite la ejecución de un bloque de código un número determi...

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Curso de Python para biólogos - Lección 5. Funciones y ejercicios prácticos
Hoy descansaremos un poco y sólo explicaremos un nuevo concepto teórico, pero muy importante, las funciones en Python. Tras ello se propondrán varios ejercicios para aplicar los conocimientos adquiridos en las lecciones previas ( 1 , 2 , 3 y 4 ). Funciones ...
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